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Thème de recherche

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Je travaille sur la modélisation mathématique, la simulation et la réduction d'ordre de flux occulaires et de leurs interactions. Les modèles sont simulés à l'aide de la librairie Feel++ [1], à laquelle je participe au développement.

En parallèle, j'ai participé au CEMRACS 2023 sur le thème « Scientific Machine Learning », et ai travaillé sur un projet d'estimation d'interactions dans des communautés microbiennes en utilisant des réseaux de neurones. Ce projet a été proposé par Lorenzo Sala de l'INRAE de Jouy-en-Josas.

Pré-publications

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• Paguiel Javan Hossie, Béatrice Laroche, Thibault Malou, Lucas Perrin, Thomas Saigre, Lorenzo Sala. Simulating interactions in microbial communities through Physics Informed Neural Networks: towards interaction estimation. 2024. Submitted.
• Thomas Saigre, Christophe Prud'Homme, Marcela Szopos. Model order reduction and sensitivity analysis for complex heat transfer simulations inside the human eyeball. 2023. Submitted.

Exposés scientifiques

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Peer reviewed conference proceedings

• Thomas Saigre, Christophe Prud'Homme, Marcela Szopos, Vincent Chabannes. A coupled fluid-dynamics-heat transfer model for 3D simulations of the aqueous humor flow in the human eye. CMBE24, Jun 2024, Arlington (Virginia), United States.

Présentations orales

• 30 janvier 2024 : Journées numériques de Besançon 2024 : Model order reduction and sensitivity analysis for complex heat transfer simulations inside the human eyeball
• 16 janvier 2024 : Séminaire EDP de l'IRMA : Modèle de réduction d'ordre et analyse de sensibilité pour les simulations de transfert de chaleur de chaleur à l'intérieur du globe oculaire humain
• 12 octobre 2023 : Séminaire doctorant de l'IRMA : Estimation des interactions dans les communautés microbiennes via un algorithme GSA basé sur un réseau de neurones
• 13 September 2023 : CompBioMed Conference 2023 : Model Order Reduction and Sensitivity Analysis for complex ocular simulations inside the human eyeball (abstract)
• 23 août 2023 : CEMRACS 2023, avec Paguiel Javan Hossie et Lucas Perrin : Estimation of interactions in microbial communities via a neural network-based generalized smoothing algorithm
• 15 juin 2023 : Séminaire doctorant de l'IRMA : Réduction de modèles et analyse de sensibilité appliqué à un modèle biophysique dans l'œil humain
• 28 February 2023 : Siam Conference on Computational Science and Engineering (CSE23), in Amsterdam : Model Order Reduction for Complex Ocular Simulations Inside the Human Eyeball (abstract)
• 1^er décembre 2022 : Séminaire Jeunes Chercheurs, au Laboratoire Mathématiques de Reims : Modèles de réduction d’ordre des simulations oculaires complexes dans l’œil humain
• 9 décembre 2021 : Séminaire doctorant de l'IRMA : Construction de jeux de tuiles apériodiques sur grille hexagonale

Poster dans des congrès

• CANUM 2020, 13 juin 2022 et JMBS 2022, 3 - 7 octobre 2022 : Model order reduction for complex ocular simulations inside the human eyeball , update :

Stages et mémoires

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• 2021 Stage de seconde année au Master CSMI : Méthode de réduction d'ordre pour un modèle poreux-élastique et couplage avec un système d'équations différentielles ordinaires, sous la direction de Christophe Prud'homme.
• 2020 Stage de première année au Master CSMI : Modélisation et simulation hygrothermique, sous la direction de Vincent Chabannes, Zohra Djatouti, Romain Hild & Christophe Prud'homme.
• 2019 Stage du Magistère : Méthodes de construction de jeux de tuiles apériodiques sur grilles hexagonales, sous la direction de Martin Delacourt et Nicolas Ollinger.
• 2018 Mémoire du Magistère : Automates cellulaires, sous la direction de Michel Coornaert.

Références

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[1] Feel++ V111.0-alpha.3